陈迪俊 副教授

    陈迪俊，南京大学生命科学学院副教授、博导，“登峰人才支持计划”入选者（B层次）。2008年毕业于哈尔滨医科大学，获学士学位；2012年赴德留学，在哈勒-维腾贝格大学（德国公立综合大学）获得博士学位。2015-2019年先后在波茨坦大学、洪堡大学进行博士后研究工作。2019年10月起受聘于南京大学生命科学院，主要从事基因转录调控的生物信息学研究。共发表SCI收录论文40余篇，其中以第一或通讯作者（含共同）身份在Nat Commun（2018/2019/2022a/2022b）、Nat Plants（2018）、Plant Cell（2014）、Nucleic Acids Res（2012/2014）、GigaScience（2018）、Commun Biology（2018）、Brief in Bioinformatics（2018）、Bioinformatics（2010）等国际主流杂志发表学术论文20余篇，参与编写专著3部。

教育背景：

2003.09-2008.06:   哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，生物信息学，学士
2010.09-2012.06:   华中农业大学，信息学院，生物信息学，硕士，导师：陈玲玲教授/合作导师：陈铭教授（浙江大学）
2012.07-2015.04:   [德国]哈勒-维腾贝格大学/IPK研究所，生物信息学，博士，导师：Prof. Thomas Altmann / Dr. Christian Klukas

工作经历：

2008.07-2010.08:   浙江大学，生命科学学院，生物信息学，科研助理，合作导师：陈铭教授
2015.05-2016.09:   [德国]波茨坦大学，生物信息学，博士后，导师：Prof. Kerstin Kaufmann
2016.10-2019.09:   [德国]洪堡大学，生物信息学，博士后，导师：Prof. Kerstin Kaufmann
2019.10-:                南京大学，副教授/博导

主要研究方向：

1、生物信息学/Bioinformatics
2、调控基因组学/Regulatory Genomics
3、进化基因组学/Evolutionary Genomics

主要研究介绍：
        生命个体由多种不同形态和功能的细胞类型组成，基因表达调控是使细胞中基因的表达在时间上和空间上处于有序状态，并对环境条件的变化做出反应的重 要过程。精准的基因表达调控是维持生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础，而异常的基因表达调控会导致包括恶性肿瘤在内的多种疾病。
        课题组主要结合基因组大数据、统计/机器学习（人工智能）、生物信息学等方法及高通量实验技术（如单细胞测序技术）在分子水平上研究个体发育和疾病发展过程中的基因表达时空特异性，解析个体生长发育和恶性肿瘤分化及转移的分子机理。研究课题主要涉及以下两个方面：

1、在单细胞水平上研究炎癌转化和癌症转移（重点关注胰腺癌、肠道癌、妇科癌症等）的分子机制，为癌症的个体化精准治疗提供新靶标和新策略；
2、采用多组学大数据和比较/进化基因组学等手段，解析重要农作物（以水稻和小麦为研究对象）生长发育相关的调控生物学基础，为作物的精准遗传改良提供理论依据。

更多信息请访问实验室主页：https://compbio.nju.edu.cn

中国生物信息学学会（筹）多组学与整合生物学专业委员会 委员

江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会 委员

浙江省生物信息学会人工智能专委会  委员

江苏省植物学会青年工作委员会 委员

Selected Publication (^#Co-first Authors; ^*Co-corresponding Authors)

1. Dynamic control of enhancer activity drives stage-specific gene expression during flower morphogenesis.

Yan W^#, Chen D^#,*, Schumacher J, Durantini D, Engelhorn J, Chen M, Carles CC, Kaufmann K^*

Nature Communications 2019 Apr 12;10(1):1705.  doi: 10.1038/s41467-019-09513-2.

2. Architecture of gene regulatory networks controlling flower development in Arabidopsis thaliana.

Chen D^#,*, Yan W^#, Fu LY, Kaufmann K^*

Nature Communications 2018 Oct 31;9(1):4534. doi: 10.1038/s41467-018-06772-3.

3. Dynamic and spatial restriction of Polycomb activity by plant histone demethylases.

Yan W^#,*, Chen D^#, Smaczniak C, Engelhorn J, Liu H, Yang W, Graf A, Carles CC, Zhou DX, Kaufmann K^*

Nature Plants 2018 Aug 13. doi: 10.1038/s41477-018-0219-5.

4. Dissecting the phenotypic components of crop plant growth and drought responses based on high-throughput image analysis.

Chen D, Neumann K, Friedel S, Kilian B, Chen M, Altmann T, Klukas C^*

Plant Cell 2014 Dec;26(12):4636-55. doi: 10.1105/tpc.114.129601.

5. Dissecting the chromatin interactome of microRNA genes.

Chen D, Fu LY, Zhang Z, Li G, Zhang H, Jiang L, Harrison AP, Shanahan HP, Klukas C, Zhang HY, Ruan Y^*, Chen LL^*, Chen M^*

Nucleic Acids Research 2014 Mar;42(5):3028-43. doi: 10.1093/nar/gkt1294.

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